Sítio Ativo de Enzima & pH

Sítio Ativo de Enzima & pH é um laboratório interativo de bioquímica em 3D que mostra como enzimas globulares reconhecem substratos específicos e catalisam reações. Os alunos arrastam a molécula de substrato verde para a fenda esculpida do sítio ativo para acionar um abraço conformacional de ajuste induzido que divide o substrato em produtos. Eles também podem arrastar um inibidor competitivo vermelho para o sítio ativo ou um inibidor não competitivo roxo para o bolso alostérico lateral. Controles deslizantes para temperatura, pH da solução e concentração de substrato atualizam leituras em tempo real para taxa de reação, conformação do sítio ativo, porcentagem de enzima ligada e Vmax efetiva.

• Arraste a molécula de substrato verde para a fenda brilhante do sítio ativo e observe as mandíbulas da enzima se fecharem por ajuste induzido antes de liberar dois lobos de produtos.
• Eleve a temperatura acima de 46 °C e observe as mandíbulas da enzima se desdobrarem à medida que a desnaturação térmica destrói o sítio ativo e reduz a taxa de reação.
• Selecione o inibidor competitivo e eleve a concentração de substrato para 100 mM para ver como níveis altos de substrato podem superar um bloqueador competitivo.
• Selecione o inibidor não competitivo para se ligar ao bolso alostérico e observe por que adicionar mais substrato não consegue restaurar a Vmax.
• Varie o pH da solução de 1 a 14 para encontrar o ótimo de pH neutro 7 e observe a desnaturação em ácido ou álcali forte.

1. 1Explique o modelo de ajuste induzido da catálise enzima-substrato e como as enzimas reduzem a energia de ativação.
2. 2Descreva por que temperaturas extremas altas ou valores extremos de pH causam desnaturação irreversível do sítio ativo.
3. 3Distingua entre inibição competitiva no sítio ativo e inibição não competitiva em um sítio alostérico.
4. 4Previna como a concentração de substrato afeta a taxa de reação na presença e ausência de inibidores.

Perguntas frequentes dos professores