Trung tâm hoạt động của enzyme & pH

Trung tâm hoạt động của enzyme & pH là một phòng thí nghiệm hóa sinh 3D tương tác cho thấy cách các enzyme hình cầu nhận diện các cơ chất cụ thể và xúc tác các phản ứng. Học sinh kéo phân tử cơ chất màu xanh lá cây vào khe trung tâm hoạt động được điêu khắc để kích hoạt một cái ôm cấu hình khớp cảm ứng giúp tách cơ chất thành các sản phẩm. Các em cũng có thể kéo chất ức chế cạnh tranh màu đỏ vào trung tâm hoạt động hoặc chất ức chế không cạnh tranh màu tím vào túi dị lập thể bên cạnh. Các thanh trượt nhiệt độ, pH dung dịch và nồng độ cơ chất cập nhật các thông số trực tiếp về tốc độ phản ứng, cấu hình trung tâm hoạt động, tỷ lệ phần trăm enzyme liên kết và Vmax hiệu dụng.

• Kéo phân tử cơ chất màu xanh lá cây vào khe trung tâm hoạt động đang phát sáng và quan sát hàm enzyme đóng lại bằng khớp cảm ứng trước khi giải phóng hai thùy sản phẩm.
• Nâng nhiệt độ trên 46 °C và quan sát hàm enzyme mở ra khi sự biến tính nhiệt phá hủy trung tâm hoạt động và làm giảm tốc độ phản ứng.
• Chọn chất ức chế cạnh tranh và nâng nồng độ cơ chất lên 100 mM để xem mức cơ chất cao có thể vượt qua chất chặn cạnh tranh như thế nào.
• Chọn chất ức chế không cạnh tranh để liên kết túi dị lập thể và quan sát lý do tại sao việc bổ sung thêm cơ chất không thể khôi phục Vmax.
• Thay đổi pH dung dịch từ 1 đến 14 để tìm điểm tối ưu pH trung tính 7 và quan sát sự biến tính trong axit hoặc kiềm mạnh.

1. 1Giải thích mô hình khớp cảm ứng của quá trình xúc tác enzyme-cơ chất và cách enzyme làm giảm năng lượng hoạt hóa.
2. 2Mô tả lý do tại sao nhiệt độ cực cao hoặc giá trị pH cực đoan gây ra sự biến tính không thể đảo ngược của trung tâm hoạt động.
3. 3Phân biệt giữa sự ức chế cạnh tranh tại trung tâm hoạt động và sự ức chế không cạnh tranh tại vị trí dị lập thể.
4. 4Dự đoán cách nồng độ cơ chất ảnh hưởng đến tốc độ phản ứng khi có mặt và không có mặt chất ức chế.

Câu hỏi giáo viên thường đặt ra